Kaisa_2012_3_photo by Veikko Somerpuro

Ilmoittaudu

Aikataulu

Tästä osiosta löydät kurssin opetusaikataulun. Tarkista mahdolliset muut aikataulut kuvauksesta.

PäivämääräAikaOpetuspaikka
Ma 25.5.2015
16:30 - 19:00
To 28.5.2015
16:30 - 19:00
Ma 1.6.2015
16:30 - 18:00
Ke 3.6.2015
16:30 - 18:00
To 4.6.2015
16:30 - 18:00
Ma 8.6.2015
16:30 - 18:00
Ke 10.6.2015
16:30 - 18:00
To 11.6.2015
16:30 - 18:00
Ma 15.6.2015
16:30 - 18:00
Ti 16.6.2015
16:30 - 18:00

Ilmoittautuminen ja opintomaksu

30,00

Kuvaus

52039 Biostatistiikka I, 2 op tai 510014 Tilastotiedettä biokemisteille, 3 op (tai vastaavia matematiikan/tilastotieteen opintoja)

Kurssin jälkeen opiskelija tietää bioinformatiikan yleisimmät sovelluskohteet, tuntee tärkeimmät biotietokannat sekä palvelimet, ja ymmärtää yleisellä tasolla miten eri menetelmät toimivat.

Molekyylibiotieteiden tai biologian 2-3.opiskeluvuosi

Kurssilla käsitellään sekvenssianalyysiin liittyviä menetelmiä, biotietokantoja (kuten NCBI Genbank, EMBL, Uniprot), kahden ja useamman sekvenssin rinnastuksen teoriaa ja käytäntöä (pisteytysmatriisit, pistekartat, rinnastusalgoritmeja) tietokantahakualgoritmeja (BLAST) sekä fylogeneettisten puiden rekonstruointia. Lisäksi tutustutaan geenikartoituksen perusteisiin, mikrosirudatan analyysin perusteisiin sekä lyhyesti genomiikkaan, promoottorianalyysiin ja farmakogenetiikkaan. Luentokurssi on siis johdanto bioinformatiikan perusmenetelmiin ja niiden taustalla olevaan teoriaan.

Luennot, laskuharjoitukset ja lopputentti

Opetus
ma 25.5. klo 16.30-19 ja to 28.5. klo 16.30-19
ma, ke ja to 1.6. -11.6. klo 16.30-18 ja ma ja ti 15.6.-16.6.15 klo 16.30-18

HUOM: mikäli sinulla on käytössäsi kannettava tietokone niin ota mukaan!

Verkko-oppimisympäristö Moodle:

Opintojaksolla on käytössä opetuksen tukena verkko-oppimisympäristö Moodle. Sivut avautuvat ennen opintojen alkua.  

Avoimen yliopiston Omat sivut -palvelusta löydät Moodle-linkin ja ensimmäisellä kirjautumiskerralla tarvitsemasi kurssiavaimen. Saat linkin ja kurssiavaimen myös sähköpostitse pari päivää ennen opintojen alkua.

Luentomateriaalit.
Oheislukemistona esimerkiksi CSC:n Mattila, Saren, Tuimala: Sekvenssianalyysiopas sekä Tuimala: Bioinformatiikan perusteet

Tentti, asteikolla 0-5

 

Tenttipäivät:

- ke 24.6.15 klo 16-19  

Uusintatentit la 12.9.15 ja la 7.11.15 klo 9-12

Katso tenttipaikka tenttipaikkalistalta

Opintomaksuun sisältyy kolme tenttikertaa.   Tutustu tenttiohjeisiin

Ilmoittaudu valitsemaasi tenttiin viimeistään 10 vrk ennen tenttipäivää Avoimen yliopiston Omat sivut-palvelussa.

 

Ilmoittautuminen alkaa 14.4.2015

Maksu  30,00 euroa
Ilmoittautuminen on sitova. Tutustu ilmoittautumis- ja maksuehtoihin. Opintomaksu maksetaan heti ilmoittautumisen yhteydessä verkkopankkitunnuksilla verkkopankissa tai luottokortilla. Lisätietoa maksuista.

Opintoihin voi ilmoittautua niiden alkamiseen asti. Lisätietoa ilmoittautumisesta.
Kirjatentteinä suoritettaviin opintojaksoihin tulee ilmoittautua viimeistään 10 vuorokautta ennen tenttipäivää. Ilmoittautumisen yhteydessä tulee ilmoittaa myös tentittävä kirjallisuus.

Verkkoilmoittautuminen edellyttää maksutonta rekisteröitymistä palvelun käyttäjäksi, Helsingin yliopiston opiskelijat voivat ilmoittautua opintoihin käyttäen Helsingin yliopiston käyttäjätunnusta.

Ilmoittautuminen opintojaksolle (tästä)

 

Toteuttaja

Helsingin yliopiston Avoin yliopisto
http://www.helsinki.fi/avoin

Opiskelijaneuvonta, tenttipalvelu ja opintojen ohjaus 

Opiskelijaneuvonta on yliopiston päärakennuksessa (1. krs.), Fabianinkatu 33.
Yhteystiedot ja aukioloajat

 

Helsingin yliopiston käyttäjätunnus

Sinulle myönnetään opintojesi ajaksi Helsingin yliopiston käyttäjätunnus. Sillä saat käyttöösi mm. Moodle -oppimisympäristön, Flamman ja kirjaston sähköiset aineistot. Pääset kirjastotietokantoihin NELLI-portaalin kautta.

Saat käyttöluvan aktivointiohjeet sähköpostiisi ennen opintojen alkua.

Käyttäjätunnuksen aktivointi edellyttää henkilökohtaista tai vahvaa sähköistä tunnistamista . Jos aiempia opintojasi varten aktivoitu käyttäjätunnus on vanhentunut, aktivoi se uudelleen hakemalla uusi salasana.

Helsingin yliopiston perustutkinto-opiskelijat käyttävät opinnoissa HY:n voimassaolevaa tunnusta.

 

Opetuspaikat näet tämän sivun alareunassa.

Opetuspaikkoihin saattaa tulla muutoksia, tarkista opetuspaikka opinto-ohjelmasta ennen opintojen alkua.  Opetuspaikkojen sijainnit. Näet opetuspaikan sijainnin myös tämän sivun alareunassa olevasta opetuspaikan linkistä. Voit tarkistaa Helsingin yliopiston opetustilojen esteettömyyden opetustilojen esittely -sivuilta. Ota tarvittaessa yhteyttä Opiskelijaneuvontaan.

Voit hyödyntää Flamman Opintoni- ikkunan kalenteria (kirjautuminen Helsingin yliopiston käyttäjätunnuksella). Jakson tiedot päivittyvät Flammaan noin vuorokauden sisällä ilmoittautumisesta.

yliopistolehtori Päivi Onkamo

Tämä luentokurssi pitää suorittaa ennen Bioinformatiikan työkurssia.