Kaisa_2012_3_photo by Veikko Somerpuro

Ilmoittaudu
Moodle
Kirjaudu sisään nähdäksesi Moodlen kurssiavaimen.

Aikataulu

Tästä osiosta löydät kurssin opetusaikataulun. Tarkista mahdolliset muut aikataulut kuvauksesta.

PäivämääräAikaOpetuspaikka
Ti 2.5.2017
17:00 - 19:30
To 4.5.2017
17:00 - 19:30
Ma 8.5.2017
17:00 - 19:30
Ke 10.5.2017
17:00 - 19:30
To 11.5.2017
17:00 - 19:30
Ma 15.5.2017
17:00 - 19:30
Ke 17.5.2017
17:00 - 19:30
To 18.5.2017
17:00 - 19:30
Ma 22.5.2017
17:00 - 19:30
Ti 23.5.2017
17:00 - 19:30

Ilmoittautuminen ja opintomaksu

45 euroa. Lisätietoja.

Ilmoittautuminen alkaa 45 vuorokautta ennen ensimmäisen opintojakson alkua. Tarkka ilmoittautumisaika näkyy Ilmoittaudu painikkeesta.

Avoimen yliopiston kesäopetus on maksutonta ilmoittautumishetkellä läsnä oleville Helsingin yliopiston perustutkinto-opiskelijoille. Ilmoittautuminen Avoimen yliopiston ilmoittautumisjärjestelmän kautta.

Miten opiskelemaan?

Kuvaus

Kurssin jälkeen opiskelija tietää bioinformatiikan yleisimmät sovelluskohteet, tuntee tärkeimmät biotietokannat sekä palvelimet, ja ymmärtää yleisellä tasolla miten eri menetelmät toimivat.

Kurssilla käsitellään sekvenssianalyysiin liittyviä menetelmiä, biotietokantoja (kuten NCBI Genbank, EMBL, Uniprot), kahden ja useamman sekvenssin rinnastuksen teoriaa ja käytäntöä (pisteytysmatriisit, pistekartat, rinnastusalgoritmeja) tietokantahakualgoritmeja (BLAST) sekä fylogeneettisten puiden rekonstruointia. Lisäksi tutustutaan geenikartoituksen perusteisiin, mikrosirudatan analyysin perusteisiin sekä lyhyesti genomiikkaan, promoottorianalyysiin ja farmakogenetiikkaan. Luentokurssi on siis johdanto bioinformatiikan perusmenetelmiin ja niiden taustalla olevaan teoriaan.

Luennot, laskuharjoitukset verkkotentti.

Luentomateriaalit.
Oheislukemistona esimerkiksi CSC:n Mattila, Saren, Tuimala: Sekvenssianalyysiopas sekä Tuimala: Bioinformatiikan perusteet.

Opintojaksolla on käytössä opetuksen tukena verkko-oppimisympäristö Moodle. Sivut avautuvat ennen opetuksen alkua.

Verkkotenttipäivät:
ke 7.6.17 klo 17-20, ma 28.8.17 klo 17-20 ja la 11.11.17 klo 9-12.
Opintomaksuun sisältyy opinto-ohjelmassa mainitut tenttipäivät.

Varaamme oikeuden muutoksiin opinto-ohjelmassa.

Opiskelun käytännönohjeita

Katso yhteystiedot oppiainesivulta.